A administração da FECRA efetiva-se através da seguinte estrutura organizacional:

I – Órgãos Colegiados:

a) Conselho Diretor (CONDIR)

b) Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão (COEPE)

c) Conselho do Instituto Superior de Educação (CISED)

d) Colegiado de Curso

II – Órgãos Executivos

a) Diretoria Geral

b) Coordenadoria do Instituto Superior de Educação

c) Coordenações de Curso

Conselho Diretor é o órgão supremo de deliberação sobre as diretrizes e as políticas de ação da Faculdade.

Conselho de Ensino, Pesquisa e Extensão é o órgão normativo, deliberativo e consultivo sobre as diretrizes e normas de funcionamento da Faculdade de Educação de Costa Rica e de assessoramento do Diretor Geral.

Conselho do Instituto Superior de Educação é o órgão normativo e deliberativo do Instituto Superior de Educação.

Colegiado de curso é um órgão consultivo e deliberativo sobre as diretrizes e normas de funcionamento de cada curso.

Diretoria Geral é o órgão executivo superior que superintende e supervisiona as atividades da Faculdade.

Coordenadoria do Instituto Superior de Educação é um órgão executivo que superintende, coordena e avalia as atividades acadêmicas do Instituto Superior de Educação Lauradaiane.

Coordenação de curso é um órgão de ensino, pesquisa e extensão para os fins da organização administrativa, didático-científica e de distribuição de pessoal, compreendendo o projeto pedagógico do curso por ela coordenado e a articulação com os demais setores da Instituição.